Op basis van een extrapolatie van de LMN-gegevens is het geschatte totale watergebruik in de varkenshouderij in 2019 10,5 miljoen m³. Ongeveer 71% van het water pompen de varkenshouders zelf op uit de grond. De gespecialiseerde varkenshouderij is in 2019 goed voor 16% van het totale watergebruik.
Water is een belangrijk productiemiddel in de varkenshouderij. In 2019 verbruikten de gespecialiseerde varkensbedrijven 15,9% (10,5 miljoen m³) ) van het totale verbruikte water in de Vlaamse land- en tuinbouwsector. Een gespecialiseerde varkensbedrijven gebruikt gemiddeld 2,6 m³ water per omgerekend varken. Naast het drinkwater voor de dieren moeten de stallen frequenter gereinigd worden dan bij runderen. Voor een luchtwasser (om geur, ammoniakemissie en fijn stof terug te dringen) is er een aanzienlijke hoeveelheid water nodig.
De sector gebruikt vooral grondwater (71% in 2019) en in beperkte mate hemel-, leiding- en oppervlaktewater. Het aandeel duurzaam water is 35% in 2019. Voor de periode 2011-2018 was dit gemiddeld 31%.